




как я понял мои ошибки были следующие:
1. не обновил portupgrade, а именно это требует первым делом рекомендация
2. указав явно xorg-6.9.0, я обновил сам xorg, но есть ещё и xorg-server и ему подобные, которые зависят от старых пакетов xorg, поэтому поучилась петрушка с пакетами
3. ну и всё-таки для начала нужно было сделать portupgrade -a, поскольку в этом случае обновление пройдёт автоматом, поскольку от xorg'а зависят многие пакеты. А когда заткнётся на xorg'e, выполнить мегребэйз и сделать символическую ссылку /usr/X11R6 => /usr/local, продолжить обновление.