сам по себе изменился .cshrc в папке /root

[Dmitriy.A]

Что может быть - какими прогами искать руткиты? Так же замечено странное поведение csh

[Хостинг HostFood.ru]

Тарифы на хостинг в России, от 12 рублей: https://www.host-food.ru/tariffs/hosting/
Тарифы на виртуальные сервера (VPS/VDS/KVM) в РФ, от 189 руб.: https://www.host-food.ru/tariffs/virtualny-server-vps/
Выделенные сервера, Россия, Москва, от 2000 рублей (HP Proliant G5, Intel Xeon E5430 (2.66GHz, Quad-Core, 12Mb), 8Gb RAM, 2x300Gb SAS HDD, P400i, 512Mb, BBU):
https://www.host-food.ru/tariffs/vydelennyi-server-ds/
Недорогие домены в популярных зонах: https://www.host-food.ru/domains/

[zingel]

chkrootkit
rkhunter

смотрите в /var/log/security && /var/log/auth.log, кроме этого...и в крон загляните

p.s. то, что найдёте - не выбрасывайте, а поделитесь.

[manefesto]

систему обновлял ?
mergemaster делал ?
если да то он по дефолту хочет вернуть .cshrc в первоначальный вид